Thomas Barnay est Professeur de sciences économiques à l'UPEC, au sein de l’ERUDITE. Il est co-porteur du pilier Health Economics and Public Health de l'EUR LIVE, Fondateur et Directeur du Master 2 Économie de la Santé, et ancien Directeur de l’ERUDITE (2018-2021).
En disponibilité de 2021 à 2024 à Boston, aux États-Unis, il a été Professeur invité à l'Université de Harvard et lauréat français de la bourse Harkness (2021-2022), puis Professeur invité à l’Université de Northeastern (2022-2024), où il a enseigné l’économie publique et l’économie de la santé.
Par ailleurs, il est Vice-Président Recherche du Collège des Économistes de la Santé (la société savante en économie de la santé), Président du Comité Scientifique des Journées des Économistes de la Santé Français, et ancien Conseiller scientifique au ministère de la Santé (2012-2015).
Ses recherches portent sur les liens entre état de santé, conditions de travail et statut d'occupation, sur l’accès aux soins et à l’assurance maladie, sur l’économie des retraites et du vieillissement, ainsi que sur la COVID-19.